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シドニー・ブレナー博士特集回（後半）では、顕微鏡を用いた線虫の全細胞系譜追跡の偉業を振り返るとともに、CRISPR-Cas9ゲノム編集法やイメージング技術を用いた最新の細胞系譜追跡技術、技術開発にまつわる世代を超えたアイデアの伝搬とその哲学、顕微鏡（光学系）を使わないイメージング技術の台頭などについて話しました。Show notes The embryonic cell lineage of the nematode Caenorhabditis elegans. Developmental Biology, 1983…Sulstonらによって線虫の全細胞における細胞系譜が初めて明らかにされた記念碑的な論文。Sulstonは4時間に及ぶ顕微鏡観察を毎日2回繰り返すことを何年も続け、959個の細胞系譜を明らかにした。 Jey Shendre…HarvardのGeorge Churchのlabで博士課程の学生だった頃、一発の実験で細胞系譜を一斉に追跡できるテクノロジーを作れ、と言われ無茶苦茶だと思いつつ取り組んだがうまく行かなかった。独立後、ラボメンバーとともにCRISPR-Cas9によるゲノム編集を用いることで当時は不可能だったアイデアを実現させ、それがGESTALT法 (Science 2016)となった。 Whole-organism lineage tracing by combinatorial and cumulative genome editing. Science, 2016…Jey Shendreによる全く新しい細胞系譜の追跡方法。CRISPR-Cas9によるゲノム編集を人工的な配列に引き起こすことにより、生体内で変異パタンを生成させ、このパタンの系統樹を描くことにより細胞系譜を追跡するGESTALT法。ゼブラフィッシュにおける複雑な細胞系譜が顕微鏡を使わず、一度のシーケンシングによって再構成できることを世界で初めて示した。このアイデアに世界中の研究者らが触発され、多くの関連技術群が開発される契機となった。 Synthetic recording and in situ readout of lineage information in single cells. Nature, 2016…Long CaiとMichael ElowitzらによるCRISPR-Cas9と一分子RN

Event Holizon Telescopeによる人類初のブラックホールの観測とその盛り上がり、天文学者の仕事、科学における観測技術の重要性、若手研究者の活躍、マンガについて話しました。本収録はシドニー・ブレナー博士特集回のインターバルをまとめたものです。Show Notes The Event Horizon Telescope (EHT)… EHTの公式サイト 史上初、ブラックホールの撮影に成功 ― 地球サイズの電波望遠鏡で、楕円銀河M87に潜む巨大ブラックホールに迫る (アルマ望遠鏡) 本間希樹先生 (天文学者、TBS 情熱大陸)… 初めてブラックホールを観測した瞬間が映像に残されている Black hole picture captured for first time in space breakthrough (The Guardian) Astronomer slams sexists trying to tear down black hole researcher’s rep… ブラックホールの画像解析アルゴリズムを作成したKatie Boumanを巡る女性差別主義者たちの主張とその否定に関する記事 ソーシャル・ネットワーク (映画) アメリカの大学におけるフラタニティーと呼ばれる社交クラブについて Katie Bouman, What does a black hole look like (TED talk)… 当時MITの博士学生であったBoumanがブラックホールの観測と画像の再構成についてわかりやすく解説しているトーク(英語) Kazunori Akiyama ロザリンド・フランクリン 二重螺旋 完全版 惑星のさみだれ (マンガ)

シドニー・ブレナー博士特集回（前半）。RNAタイクラブ、シドニー・ブレナーによる遺伝暗号解明へのアプローチ、ガモフの仮説、コドンとアミノ酸の対応関係、ファージを用いた遺伝学について、1950~60年初頭に出版された当時の原著論文を紹介し、分子生物学の黎明期における美しい実験や大胆な仮説と発見のドラマについて話しました。Show Notes Sydney Brenner (Microsoft Academic)… シドニー・ブレナー博士の業績一覧 RNA Tie Club… RNAタイクラブでは、DNA上の情報を元にタンパク質が作られる仕組みを解明しようとした。構成メンバー数はアミノ酸の数にならい20人。メンバーは二重らせん柄のネクタイを締めアミノ酸由来のコードネームを持っていた。ガモフ: アラニン、クリック: チロシン、ワトソン:プロリン、ブレナー：バリン。20人中8人がノーベル賞を受賞した。モットーは”do or die; or don’t try”だった。 The most beautiful wrong ideas in science… ガモフのダイアモンド仮説について、当時の状況や考察が書かれている。タイトルが秀逸。 On the impossibility of all overlapping triplet codes in information transfer from nucleic acid to proteins. (Brenner. PNAS, 1957.)… ブレナーが3文字からなるオーバーラップコドン仮説を否定した論文。当時既知であったアミノ酸配列を用いて、簡単な計算からとても美しい回答を出した。付録にあるアミノ酸配列一覧は必見。 Possible Relation between Deoxyribonucleic Acid and Protein Structures. (Gamow. Nature. 1954.) Mattew Meselson… メセルソンはDNAの半保存的複製を同位体標識を用いることで証明した後、mRNAの証明にブレナーとヤコブとともに取り組んだ。ブレナーとヤコブはそれぞれ、線虫の研究とオペロンの研究でノーベル賞を受賞したが、メセルソンは未だ受賞できていない。 An unstable intermediate carrying

すあまってなんですか？、かまぼことすあまの違い、ところてんの食べ方、讃岐うどん原理主義、エンジョイ勢とガチ勢、物ごとにのめり込んでいくプロセスについて、研究をする上での同僚の存在、研究におけるチームプレイ、老害と認知バイアス、人生における再現可能な部分について話しました。Show notes 清水屋のところてん 八幡巻き 東京ポッド許可局 関西人「かまぼこ？」。関東外では謎の菓子「すあま」とは 菱葩餅（ひしはなびらもち） エンジョイ勢 ニコニコ大百科 Physics paper sets record with more than 5,000 authors. Nature News Combined Measurement of the Higgs Boson Mass in pp Collisions at √s=7 and 8 TeV with the ATLAS and CMS Experiments. Phys. Rev. Lett. 114, 191803 – Published 14 May 2015 夢を語れ (ラーメン屋)について (ep05, Researchat.fm) 認知バイアス一覧で社会心理学入門 北北西に曇と往け (マンガ) ブルーラグーン (アイスランドの温泉) ジャガイモ飢饉

ポッドキャスト、日本の昔のインターネット、納豆と醤油の違い、羊羹と赤福の魅力、定食を何から食べるのか問題、ビールを飲みながら白米を食べるのか問題、ボストン周辺のラーメン事情、マンガについて話しました。Show notes Oculus GO (VR) 米シックスフラッグス、ジェットコースターとVRを組み合わせた新アトラクションお披露目 バーチャルボーイ (Wikipedia) Rebuild.fm Turing Complete FM Yahoo!ジオシティーズ サービス終了のお知らせ 画像で見る #インターネット老人会 “握力の強さ”で日本一に 「ウェブ魚拓」創業者はいかにして肉体派プログラマーになったか あまりに優美だった昭和の「おせち料理」 株式会社 虎屋 19年前のとらやの羊羹を食べてみました！ 東京新橋 切腹最中の新正堂 漫画やアニメで見た「戸棚から皿に乗せられた羊羹を取り出すシーン」を不思議に思っていたのだが、公式にこういう食べ方がある事を知る 羊羹 (Wikipedia) 阿闍梨餅本舗 京菓子司 -満月- 松下製麺所 (香川県高松市) 情熱大陸 大西益央 (ラーメン店主) Tsurumen Davis, tadasu’s blog Yume Wo Katare (Boston, MA) A yearlong Yume Wo Katare ticket leads a healthy life by Hoshii T URBAN AXES: Boston 美味しんぼ (マンガ) めしにしましょう (マンガ) マージナル・オペレーション (マンガ)

iPad ProのCapsLock問題、エルゴノミクスキーボード、エディタ、データ解析のためのプログラミング言語と環境、研究のための情報収集、最新論文の収集技術について話しました。Show notes ERGODOX EZ Kinesis keyboard デュアルキーボードでさまざまなことが解決しました。すごすぎます。勝間和代 Official web site 【更新】Word for Mac 2016でEmacs風のキーアサイン（Mac標準）を実現する（最新） The Julia Programming Language JupyterLab Feedly Digg Reader (no longer available) Google reader Nature (Twitter), Science (Twitter), Cell (Twitter) JOURNAL OF NEGATIVE RESULTS In defence of passion, Andrew Murray. 1997. Current Biology ANDREW MURRAY ミステリと言う勿れ (マンガ) LIVE A LIVE

CRISPR-Cas9使ったゲノム編集の歴史、Off-target問題、1塩基ゲノム編集、バクテリアへのデータ保存、Anti-CRISPRタンパクなどについて話しました。Show notes Multiplex Genome Engineering Using CRISPR/Cas Systems. Cong et al., Science 2012 RNA-Guided Human Genome Engineering via Cas9. Mali et al., Science 2012 Rationally engineered Cas9 nucleases with improved specificity. Slaymaker et al., Science 2016 High-fidelity CRISPR-Cas9 nucleases with no detectable genome-wide off-target effects. Kleinstiver et al., 2016 Nature Ethics aside, does the CRISPR baby experiment make scientific sense? 声明：ゲノム編集を実施したヒト受精卵から女児を誕生させたとの発表に対する懸念, 日本ゲノム編集学会 Guidelines for base editing in mammalian cells CRISPR-Cas encoding of a digital movie into the genomes of a population of living bacteria. Shipman et al., 2017 Nature ウェットなデータストレージメディアとしてのDNA. 実験医学2019年1月号 Naturally Occurring Off-Switches for CRISPR-Cas9. Pawluk et al., Cell 2016

eスポーツ、EVO JAPAN 2019、パキスタン勢とArslan Ash、eスポーツと渡航ビザ問題、格ゲー動画勢の楽しみ方、eスポーツの解説とサイエンスコミュニケーション、ウメハラの攻略法、サムライスピリッツの新作、おすすめのマンガ情報について話しました。Show notes エレクトロニック・スポーツ (Wikipedia) Evolution Championship Series (EVO) ストリートファイターV 鉄拳7 Green Arcade in South Korea Arslan Ash (Twitter) Arslan Ash vs AK: EVO Japan 2019 Tekken 7 Grand Final Arslan Ashとは (ファミ通AppVS) eFight Pass Vortex Championship S2 The picture of Vortex Championship S2 from Twitter MCZ Unveiled 2013 Daigo Umehara vs Infiltration Commentary by Daigo Umehara: Daigo Umehara vs Infiltration 将棋電王戦 (Wikipedia) 渡辺明ブログ テキサス・ホールデム (Wikipedia) SAMURAI SPIRITS / SAMURAI SHODOWN - Teaser Trailer 狼の口 ヴォルフスムント (マンガ)

tadasu、soh、coelaの3人でアメリカで見つかった珍しいザリガニ、染色体数や生物個体のサイズ、ハッカソン、強迫的ホーディングと片付け、ドラゴンボール、la la landなどについて話しました。Show Notes 今日からはじめる「技術Podcast」完全入門 Lobster Coloring (PDF) ギル（ストリートファイター） 14 Pound Lobster 7 Largest Lobsters Ever Captured Crayfish and chromosomes (2n=376) Compulsive hoarding Tidying Up with Marie Kondo (Netflix) Damien Chazelle Dragon Ball Broly … [Amazon Video] LA LA LAND … [Amazon Video] Animation Ranking in US Aquaman … [Amazon Video]